微生物分類的準(zhǔn)則和方法？

以下討論一些微生物分類的準(zhǔn)則和方法﹕
形態(tài)（結(jié)構(gòu)）特性﹕這是最原始和通用的分類方法，既簡單又經(jīng)濟(jì)，可利用肉眼和顯微鏡來觀察，一般細(xì)菌的孢子和鞭毛很容易用這方法辨識別。不過微生物間其他的結(jié)構(gòu)特性則很相似，很難只用肉眼分辨。

染色﹕利用細(xì)胞壁成份的異同，染色的方法（例如革蘭氏染色法或酸性染色法）可以用來分辨微生物的特性，醫(yī)生常用這樣的方法來辨識病原菌。不過缺乏細(xì)胞壁的細(xì)菌和細(xì)胞壁不穩(wěn)定的古細(xì)菌則無法用這種方法來鑒定。

生化檢驗(yàn)﹕縱使相近的微生物，其酵素的種類和活性可能不同，例如檢驗(yàn)微生物利用各種碳水化合物的能力，便能夠辨識微生物的類別。其他如大腸菌是缺乏氧化酵素（oxidase），Escherichia、Enterobacter、Citrobacter會將乳醣轉(zhuǎn)變成酸和氣體，而Salmonella和Shigella則不會。



血清反應(yīng)﹕血清反應(yīng)是身體免疫抗體對具有抗原性微生物進(jìn)行反應(yīng)的一個證據(jù)，利用血清反應(yīng)來檢驗(yàn)微生物，不但可以可以分辨微生物的種（species），甚至可以檢定到菌株（strain）的異同。不過，也有可能某些不同種類的菌種，卻含有相同或相似的抗原成份，因此使用此法時需配合其他分類方法，進(jìn)行驗(yàn)證。

噬菌體感染性﹕噬菌體對微生物的感染性具有高度的專一性，它對細(xì)胞膜的成份有特別的選擇性，因此像血清反應(yīng)一樣，可以用來檢驗(yàn)微生物的種類

胺基酸序列﹕微生物經(jīng)過長時間的演化后，蛋白質(zhì)的DNA編碼多少經(jīng)過改變，因此比較兩個微生物的蛋白質(zhì)序列，可以檢定DNA序列的異同，也可以判定微生物種類演化的異同，蛋白質(zhì)序列相似性越高的，其分類種類越相近。

脂肪酸種類﹕微生物會合成不同的脂肪酸，因此分析合成脂肪酸的種類，便可以分辨微生物的種類，不過需要配合其他的分類方法。

菌液流動性﹕利用菌液穿過一個小缺口，并測定微生物間和微生物與培養(yǎng)基間的導(dǎo)電性，可以測得微生物得特性。如果在缺口再加上一個雷射光，
則可以利用電腦順便測量微生物得大小、形狀、密度、和表面。如果加上得是螢光，則可以測量螢光細(xì)胞，如Pseudomonas，或標(biāo)記有螢光染色的細(xì)胞。牛乳中的Listeria污染便是可以如此檢定。

DNA鹼基的組成﹕DNA鹼基組成一般都是以鳥嘌呤（guanine；G）和胞嘧啶（cytosine；C）總和的百分比來表示（G＋C），理論上相同種類的微生物的（G＋C）的百分比應(yīng)該相同，種類相似微生物的（G＋C）的百分比應(yīng)該相近。

DNA指紋﹕特定的DNA剪切酵素（restriction enzyme）可以將相同的微生物DNA剪切成相同長度的片斷，因此兩種微生物經(jīng)過DNA剪切酵素處理后，加以電泳分離，便可以判斷剪切過的DNA片斷長度是否相同。如果DNA指紋差異越小，表示它們的親緣越近。

核醣體RNA序列﹕核醣體RNA序列是目前最常用來測定生物的差異性和它們發(fā)生起源的差別，核醣體RNA存在所有的細(xì)胞里，而且較為穩(wěn)定，容易取得�？梢岳�用聚合酵素連鎖反應(yīng)（polymerase chain reaction；PCR）和核醣體RNA的引子（primers）增殖核醣體RNA片斷，進(jìn)行序列的分析。序列相近的微生物，則親緣越近。

DNA聚合酵素連鎖反應(yīng)﹕如果微生物無法利用傳統(tǒng)的方法培養(yǎng)增殖（例如化石里的植物細(xì)胞），則可以利用聚合酵素連鎖反應(yīng)（PCR）的方法，將微生物的DNA或核醣體RNA增殖，再利用特定DNA剪切酵素或DNA序列的方法，來檢定微生物的親緣關(guān)係。

核酸雜交﹕DNA是一個雙股的基因分子，經(jīng)加熱后，雙股會鬆弛并分開，成為兩條單股。如果將這單股的DNA固定在合適的材質(zhì)上，再用已知的單股DNA探針（probes）和這固定的單股DNA反應(yīng)，如果DNA探針可以和微生物的單股DNA結(jié)合，回復(fù)雙股分子，則表示DNA探針?biāo)�代表的微生物與被測試的微生物有相同或相近的親緣。這個方法又稱為瑟慎印跡（Southern blotting）。