信息分類:生命科學(xué)資訊 作者:yiyi發(fā)布
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由電泳膠中提取DNA
本實驗採用GENECLEAN III Kit,此套實習(xí)材, 保存于室溫, 約有80﹪的DNA回收率.
材 料:
NaI液
New Wash濃縮液
TBE modifier
GCIII Elution Solution
其中NaI為6M sodium iodide solution
TBE modifier是用于泳膠, 若是以TBE與Agarose製成, 則加切下泳膠體積1/2之TBE modifier及4.5倍體積的NaI.
EZ-GLASSMILK是溶于dH2O的浮懸液, 沉淀下來, 應(yīng)沉淀與水各半, 若水分蒸散, 可加入適當(dāng)dH2O.
New Wash solution之配置:用14ml之濃縮液, 加280ml dH2O, 在與310ml 100﹪ethanol(或95﹪ethanol)溷合. 用此套實習(xí)材將DNA游泳膠中提出后, 不含ethidium bromide.
因為TBE對DNA粘附在EZ-GLASSMILK上有影響, 故在將泳膠加入NaI融化前先加入TBE modifier以去除此影響(降低pH).
方 法:
1. 以小刀片將含DNA的泳膠切出(在紫外線平臺上執(zhí)行), 秤重量, 以重量估算體積, 大約1g為1ml, 將此小塊泳膠放入1.5ml離心管中(切塊最好在0.4g以下).
2. 若電泳是在TAE中執(zhí)行者, 則不用加TBE modifier, 直接加入3倍體機(jī)的NaI液, 若電泳在TBE中執(zhí)行者, 則先加入1/2倍體積之NaI液. 將離心管置55℃水浴器中, 每隔一分鐘取出溷合一下, 再放入, 約5分鐘泳膠可完全融化.
[此套實習(xí)材也可用在為提純DNA,
即將DNA液中直接加入3倍體積的NaI液, 然后進(jìn)行下列步驟].
1. 加入適量之EZ-GLASSMILK, 加入之量以預(yù)估DNA含量有關(guān), 即每1μg DNA要加2μl, 但最初至少要加5μl, 亦即若DNA含量少5μg, 亦至少要加5μl;若多于5μg, 再每多1μg, 加2μl.
2. 充分溷合, 并置室溫5min, 每1分鐘溷合一下.
3. 離心2,500rpm, 10sec.
4. 吸除上清液, 加入400μl之New Wsah液, 充分溷合, 再離心2,500rpm, 10sec, 吸除上清, 如此再重複2次(共洗3次), 吸除上清.
5. 加入20μl之GCIII Elution Solution, 充分溷合, 離心3,000rpm, 30sec, 吸取上清, 即為所要之DNA.